Для предотвращения возможных заболеваний, уничтожения мелких насекомых или паразитов необходимо 1-2 раза в год (при необходимости — чаще) проводить дезинфекцию клеток, сарая, инвентаря.

Дезинфекции подвергают все помещения и клетки животных, вспомогательное оборудование и инвентарь, склады кормов, питьевые и сточные воды, почву, экскременты животных.

Самые распространённые препараты для дезинфекции — хлорная известь, едкий натр (каустическая сода), формалин, креолин, хлорамин.

Во всех случаях дезинфекции предшествуют освобождение помещения или его части от зверей, тщательная механическая очистка производственных помещений, клеток и кормушек. Портящееся от воды и дезсредств оборудование предварительно выносят из помещения или закрывают полиэтиленовой пленкой. Основную массу навоза и остатки корма удаляют струей воды (желательно горячей) под давлением. Оставшиеся загрязнения орошают 2%-ным раствором кальцинированной соды или 0,5%-ным раствором моюще-дезинфицирующих средств из расчета 0,5 л раствора на 1 м2 поверхности и оставляют увлажненными на 1 час, после чего повторяют очистку струей воды под давлением. Особое внимание обращают на мойку кормушек, поилок, нижней части стен, пола и навозных каналов. После удаления остатков воды помещение просушивают, обжигают клетки от остатков пуха и приступают непосредственно к дезинфекции влажным или аэрозольным способом.

Для влажной дезинфекции используют 2%-ный формальдегид, 2%-ный дезмол, 3%-ный ниртан, 1%-ный хлорамин, 2%-ный едкий натр с добавлением 2%-ного раствора танина или 1 %-ного метасиликата натрия (для снятия корродирующего действия). Перечисленные растворы применяются из расчета 1 л на 1 м2 сплошной поверхности к 0,5 л на 1 м2 сетчатой площади.

Клетки и инвентарь в теплое время года можно дезинфицировать также 3-5%-ным раствором креолина, 1-5%-ным раствором формалина, 2-3%-ным раствором кальцинированной соды. При отсутствии дезинфицирующих средств применяют зольный щелок (на 10 л воды 2 кг древесной золы; раствор 2 часа кипятят, процеживают, перед употреблением подогревают до 70-80°С).

Земляной пол в загонах и почву под выгулами клеток дезинфицируют хлорной известью. На обеззараживание 1 м2 площади надо 10-15 л 15%-ного раствора.

Закрытые помещения после удаления из них животных лучше всего дезинфицировать аэрозольным методом или парами формалина. В направленных аэрозолях используют 6%-ный раствор формальдегида и раствор гипохлора с содержанием 3%-ного активного хлора из расчета 100-200 мл/м2 поверхности (экспозиция 3 часа). Для аэрозольной обработки употребляют 20%-ный раствор формальдегида из расчета 20 мл/м3 помещения при экспозиции 12 часов.

Хлорная известь применяется в виде 1-5% раствора для дезинфекции деревянных предметов, помещений, территории участка. Каустик употребляют в виде горячего 2% раствора, после обработки помещение тщательно проветривают.

Для дезинфекции помещений, клеток и инвентаря применяют 2-4% раствор формалина или 3-5% горячую эмульсию креолина, или раствор хлорамина в воде (1:10). Подогретые до 50-60 градусов растворы более действенны, чем холодные.

Перед аэрозольной дезинфекцией необходимо герметизировать помещение (закрыть окна, двери, щели, отключить вентиляцию). Температура воздуха не должна опускаться ниже +15°С при относительной влажности 60-90%. Для нейтрализации формальдегида по истечении экспозиции в закрытое помещение вводят аэрозоль 25%-ного раствора аммиака (половина дозы формальдегида, израсходованного на дезинфекцию). Затем помещение проветривают и после полного исчезновения запаха размещают животных в сухих клетках.

Деревянные клетки обрабатывают дезинфицирующими средствами, ошпаривают кипятком или кипящим щелоком, а металлические клетки и металлические части деревянных клеток дезинфицируют огнем паяльной лампы. Кормушки, поилки, ясли, ведра и другой инвентарь дезинфицируют 10-15-минутным кипячением в воде или 5%-ном растворе щелока, а скребки, лопаты и прочее — огнем паяльной лампы. Для обеззараживания посуды используют 3-5%-ный марганцовокислый натрий.

Наряду с дезинфекцией производятся дезинсекция (с целью уничтожения паразитирующих насекомых, их яичек и личинок) и дератизация, направленная на уничтожение диких грызунов.

Действенная дезинфекция клеток паяльной лампой. Стенки загонов или сарая можно также побелить гашёной известью. На практике дезинфекцию проводят во время освободившихся клеток.

В хозяйствах нутриеводов-любителей основными методами борьбы с заболеваниями зверей служат профилактические мероприятия.